Die Trennung von System und Daten (Dokumente, Dateien) bietet zwei wichtige Vorteile:

Eine Datensicherung wird erheblich erleichtert, und ein Update, ein Wechsel auf eine neuere Windows-Version oder eine Neuinstallation des Betriebssystems kann wesentlich leichter und vor allem gründlicher erfolgen, da einfach die gesamte Betriebssystempartition komplett gelöscht und neu 'formatiert' werden kann, so dass mit Sicherheit keine übrig gebliebenen 'Reste' ungewollt Instabilitäten verursachen können. Das Installieren einer neueren Windows-Version über eine bereits bestehende Windows-Version führt oft zu Problemen und sollte vermieden werden.

System und Anwendungsprogramme auf die gleiche Partition installieren, weil:

viele Anwendungen auch Ordner und Dateien in den entsprechenden Benutzerordnern anlegen (z. B. Dokumente und Einstellungen, …) und dort dann Daten speichern. Das bedeutet die Anwendungen sind häufig eng mit dem Betriebssystem verknüpft. Man findet nicht selten, die vom Programm angelegten Dateien in mehreren unterschiedlichen Systemverzeichnissen wieder. Die Trennung von Programmen und Betriebssystem wird immer schwieriger.

Zitat: „Ohne die Programmpartition hat man ein OS mit haufenweise Müll und einer verdreckten Registry, während man ohne die Betriebssystempartition keine lauffähigen Programme mehr hat und Nutzereinstellungen meistens auch verschwunden sind, da diese in den User-Verzeichnissen abgelegt werden."

Deshalb einfach System und alle Anwendungsprogramme auf der Systempartition (normalerweise C) und die Daten (Texte, Bilder, Tabellen, Datenbanken, E-Mails, …) auf einer seperaten Datenpartition.

Mit True Image die System-Partition sichern, so daß sie im Notfall (auf der gleichen Hardwareumgebung) schnell wiederhergestellt werden kann.

Alle Programme, die ohne Installationsroutine laufen, in einen Ordner "Programme" kopieren. Diese Programme können dann hardwareunabhängig in das jeweilige System bzw. den jeweiligen Programmordner kopiert werden. Die Programme, die mit Hilfe entsprechender Installationsroutinen Eintragungen in die Registrierungsdatenbank vornehmen und sich in den unterschiedlichsten Systemordnern einnisten müssen natürlich manuell installiert werden. Möglicherweise könnte hier mit Hilfe von nLite bzw. vLite eine individuelle Windows-Installations-CD zusammengestellt werden.